Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EP300Q09472 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EP300Q09472 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EP300Q09472 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EP300Q09472 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EP300Q09472 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EP300Q09472 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP300Q09472 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EP300Q09472 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EP300Q09472 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms