Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms