Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNG1Q06432 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms