Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNB3Q05901 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms