Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CALD1Q05682 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALD1Q05682 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALD1Q05682 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms