Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCDQ05655 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRKCDQ05655 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms