Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms