Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSBP1Q04837 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP1Q04837 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms