Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL6Q02878 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL6Q02878 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms