Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSC2Q02487 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms