Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BNC1Q01954 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BNC1Q01954 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms