Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDR2Q01850 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms