Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BEX3Q00994 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms