Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNA1BQ00975 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNA1BQ00975 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms