Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HSF1Q00613 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSF1Q00613 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms