Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDLBPQ00341 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDLBPQ00341 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms