Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF5P84085 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF5P84085 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF5P84085 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARF5P84085 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF5P84085 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF5P84085 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF5P84085 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF5P84085 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF5P84085 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms