Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSBP2P81877 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms