Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOMO3P69849 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOMO3P69849 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms