Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HBBP68871 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HBBP68871 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HBBP68871 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HBBP68871 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HBBP68871 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBBP68871 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HBBP68871 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBBP68871 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBBP68871 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HBBP68871 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HBBP68871 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HBBP68871 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms