Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms