Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RPS29P62273 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RPS29P62273 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RPS29P62273 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RPS29P62273 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RPS29P62273 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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