Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VBP1P61758 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VBP1P61758 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VBP1P61758 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VBP1P61758 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VBP1P61758 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VBP1P61758 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VBP1P61758 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VBP1P61758 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VBP1P61758 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VBP1P61758 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VBP1P61758 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VBP1P61758 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VBP1P61758 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms