Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFC1-1P60608 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms