Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPI1P60174 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPI1P60174 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPI1P60174 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPI1P60174 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPI1P60174 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPI1P60174 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPI1P60174 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPI1P60174 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPI1P60174 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPI1P60174 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPI1P60174 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPI1P60174 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPI1P60174 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms