Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP107P57740 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP107P57740 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP107P57740 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP107P57740 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP107P57740 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP107P57740 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP107P57740 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP107P57740 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms