Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3BP55884 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3BP55884 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms