Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLTPP55058 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLTPP55058 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLTPP55058 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLTPP55058 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLTPP55058 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLTPP55058 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLTPP55058 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLTPP55058 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLTPP55058 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLTPP55058 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLTPP55058 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLTPP55058 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLTPP55058 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLTPP55058 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLTPP55058 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLTPP55058 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLTPP55058 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLTPP55058 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLTPP55058 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLTPP55058 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLTPP55058 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLTPP55058 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLTPP55058 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms