Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP1B3P54709 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP1B3P54709 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms