Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA2P54646 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA2P54646 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms