Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARSP54136 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARSP54136 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RARSP54136 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARSP54136 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARSP54136 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARSP54136 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARSP54136 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARSP54136 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARSP54136 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARSP54136 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARSP54136 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RARSP54136 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RARSP54136 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARSP54136 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARSP54136 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms