Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CRYBA4P53673 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms