Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LBX1P52954 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LBX1P52954 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LBX1P52954 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LBX1P52954 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LBX1P52954 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LBX1P52954 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LBX1P52954 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LBX1P52954 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms