Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF135P52742 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF135P52742 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms