Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLAP51003 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLAP51003 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms