Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VASPP50552 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VASPP50552 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VASPP50552 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VASPP50552 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VASPP50552 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VASPP50552 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VASPP50552 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VASPP50552 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VASPP50552 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VASPP50552 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VASPP50552 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms