Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GATMP50440 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATMP50440 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATMP50440 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATMP50440 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATMP50440 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATMP50440 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATMP50440 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATMP50440 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATMP50440 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATMP50440 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATMP50440 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATMP50440 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATMP50440 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATMP50440 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATMP50440 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATMP50440 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GATMP50440 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATMP50440 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATMP50440 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATMP50440 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATMP50440 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATMP50440 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms