Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP1P50238 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms