Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK1EP49674 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK1EP49674 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK1EP49674 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK1EP49674 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms