Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMAN1P49257 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMAN1P49257 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms