Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPIAP49247 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPIAP49247 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPIAP49247 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPIAP49247 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPIAP49247 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPIAP49247 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPIAP49247 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms