Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLCP48506 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLCP48506 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLCP48506 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLCP48506 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLCP48506 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLCP48506 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLCP48506 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLCP48506 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLCP48506 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLCP48506 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLCP48506 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLCP48506 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLCP48506 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLCP48506 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLCP48506 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLCP48506 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLCP48506 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLCP48506 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCLCP48506 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLCP48506 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLCP48506 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLCP48506 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLCP48506 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLCP48506 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLCP48506 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms