Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIP4K2AP48426 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIP4K2AP48426 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIP4K2AP48426 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PIP4K2AP48426 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PIP4K2AP48426 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PIP4K2AP48426 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms