Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RPL28P46779 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPL28P46779 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPL28P46779 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RPL28P46779 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RPL28P46779 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RPL28P46779 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms