Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRCC3P46736 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCC3P46736 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms