Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDKN1BP46527 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms