Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP5P45974 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP5P45974 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP5P45974 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP5P45974 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP5P45974 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP5P45974 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP5P45974 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP5P45974 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP5P45974 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP5P45974 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP5P45974 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP5P45974 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP5P45974 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP5P45974 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP5P45974 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP5P45974 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP5P45974 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP5P45974 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP5P45974 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP5P45974 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP5P45974 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP5P45974 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms