Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKX2-1P43699 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms