Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC1A4P43007 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms