Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC19A1P41440 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A1P41440 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms